序列分析/生物信息學的十個手機應用程序

【字體: 時間:2014年08月11日 來源:生物通

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  2014年8月8日,BioTechniques為進行測序和生物信息學分析的研究人員,提出了一系列可以在移動設備上運行的軟件,讓你的基因組研究變得更加便捷而有趣。了解更多……

  

生物通報道:2014年8月8日,BioTechniques為進行測序和生物信息學分析的研究人員,提出了一系列可以在移動設備上運行的軟件,讓你的基因組研究變得更加便捷而有趣。了解更多……

1、 DNAApp: iPhone/iPad / Android

現在,你可以在你的移動設備上使用這個方便的小程序,查看和分析DNA測序電泳圖(以.ab1文件格式)。

2、 BioGene: iPhone/iPad

BioGene是一種簡單而直觀的工具,通過搜索基因的符號或名稱,獲得關于一個基因的功能信息。

3、 mentha - the interactome browser: Android

mentha interactome瀏覽器的一個便攜式版本,利用各種專業數據庫匯集的數據,顯示目的蛋白的蛋白質-蛋白質相互作用(直接和酶催化)。

4、 GeneIndex: iPhone/iPad


GeneIndex提供了一種快速簡便的方法,從不同的基因指標獲得關于基因的信息。它也有一個PubMed查看器和RSS閱讀器供雜志訂閱。

5、 Genome Voyager: iPad


這個應用程序提供了方便的使用,收集整個人類基因組序列,使研究人員能夠可視化全基因組測序數據,并了解如何分析它們發現序列變異、拷貝數變化和雜合性缺失事件。

6、 YeastGenome: iPhone/iPad


用YeastGenome應用程序,尋找關于啤酒酵母(Saccharomyces cerevisae)基因和染色體特征的信息,這個程序使用來自酵母屬(Saccharomyces)基因組數據庫(SGD)的最新數據。

7、SNPdbe: iPhone/iPad 


用這個程序訪問SNP數據庫SNPdbe,以獲得單一氨基酸置換結構和功能影響的實驗和計算派生注釋。

8、SimGene: iPhone/iPad / Android


通過與各種數據庫相連接,如Simbiot、Ensembl、NCBI、Gene Ontology、PubMed等,這個應用程序提供了來自30多個物種基因的最新注釋,它還包括一個基因組瀏覽器,可顯示基因、轉錄本、外顯子和SNPs的信息。

9、TimeTree: iPhone/iPad


利用來自科學文獻的分子鐘估算,探索不同生物的分歧時間,了解地球上生命的進化時間尺度。

10、GeneGroove: iPhone/iPad


如果你看夠了利用上述應用程序所進行的基因組序列詳細生物學分析,你可以通過GeneGroove應用程序,隨著音樂的韻律熱動而變速并沉溺于你內心的音樂,利用23andMe基因組序列數據(無論是自己的,還是應用程序所提供的基因組樣本),這種程序會產生一種音樂旋律。

(生物通:王英)

更多閱讀:Nature子刊:新型強大的基因發現工具

http://www.biotechniques.com/news/Ten-Apps-for-Busy-Researchers-Sequence-AnalysisBioinformatics/biotechniques-353252.html

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